Cytoscape
Cytoscape

Cytoscape3.9.1

官方版无广告2

更新日期:
2026年7月23日
语言:
中文
平台:

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Cytoscape 是开源跨平台复杂网络分析可视化平台,最初面向生物信息学开发,支持 Windows、macOS、Linux 系统,以节点 – 边网络图为核心载体,实现网络导入、属性数据融合、拓扑计算、聚类挖掘与可视化绘图。软件采用插件(App)扩展架构,内置官方应用商店,按需拓展领域专用分析工具。
核心功能:
  1. 多源网络导入:支持 CSV、TSV、SIF、CX、SBML、BioPAX 等格式,可导入蛋白互作、基因调控、代谢通路、文献共现网络;
  2. 网络拓扑分析:计算度中心性、介数中心性、最短路径、网络密度,识别 Hub 核心节点;支持 MCL、Louvain 等算法进行模块聚类;
  3. 多组学数据融合:将基因表达、差异倍数、理化属性映射至节点颜色、大小、形状、透明度,直观关联网络结构与定量实验数据;
  4. 通路富集分析:依托各类插件完成 GO、KEGG 富集,解析模块生物学功能;
  5. 丰富布局算法:环形、力导向、层次布局、边捆绑等,优化大型网络可读性;
  6. 自动化与协同接口:CyREST API 支持 Python、R 脚本批量处理;矢量图导出 SVG、PDF,满足期刊配图规范。
广泛应用生物信息学(蛋白互作、代谢网络、转录调控)、药学网络药理学、文献计量网络、社交网络、材料分子关联研究。

更多详情及安装教程请访问:Cytoscape

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